| 序號 | 研究機構名稱 | 負責人 | 機構級別 |
| 1 | 中國經濟特區研究中心 | 陶一桃 | 部省共建人文社會科學重點研究基地 |
| 2 | 港澳基本法研究中心 | 鄒平學 | 全國人大常務委員會港澳基本法委員會重點研究基地 |
| 3 | 知識產權司法保護理論研究基地 | 朱謝群 | 最高人民法院重點研究基地 |
| 4 | 國家文化創新研究中心 | 李鳳亮 | 文化和旅游部研究基地 |
| 5 | 中國質量經濟發展研究院 | 劉偉麗 | 國家市場監督管理總局共建基地 |
| 6 | 當代中國政治研究所 | 黃衛平 | 廣東省高校人文社會科學重點研究基地 |
| 7 | 傳媒與文化發展研究中心 | 吳予敏 | 廣東省高校人文社會科學重點研究基地 |
| 8 | 文化產業研究院 | 李鳳亮 | 廣東省高校人文社會科學重點研究基地 |
| 9 | 黨內法規研究中心 | 谷志軍 | 廣東省高校人文社會科學重點研究基地 |
| 10 | 創新型城市建設與治理研究中心 | 李清泉 | 廣東省協同創新平臺 |
| 11 | 美學與文藝批評研究院 | 高建平 | 中國社會科學院研究生院共建研究基地、深圳市人文社科重點研究基地 |
| 12 | 移民文化研究所 | 劉志山 | 廣東地方特色文化研究基地 |
| 13 | 饒宗頤文化研究院 | 劉洪一 | 廣東省嶺南文化研究基地、深圳市人文社科重點研究基地 |
| 14 | 馬克思主義文藝理論與文藝批評建設工程文藝理論研究深圳基地 | 王雙印 | 中國社會科學院馬克思主義研究院共建研究基地 |
| 15 | 創新發展法治研究院 | 葉衛平 | 廣東省法學會法治研究基地 |
| 16 | 體育文化研究所 | 陳小蓉 | 國家體育總局體育文化發展中心重點研究基地 |
| 17 | 深圳現代藝術與設計研究中心 | 齊鳳閣 | 深圳市文體旅游局重點研究基地 |
| 18 | 深圳國際化發展戰略研究中心 | 姜安 | 深圳市對外事務辦公室重點研究基地、深圳市人文社科重點研究基地 |
| 19 | 廉政研究院 | 盧成燕 | 深圳市人文社科重點研究基地 |
| 20 | 經濟特區立法研究中心 | 黃亞英 | 深圳市人大常委會重點研究基地 |
| 21 | 規制與公共政策研究中心 | 葉衛平 | 深圳大學人文社科重點研究基地 |
| 22 | 印度研究中心 | 郁龍余 | 深圳大學人文社科重點研究基地 |
| 23 | 國學研究所 | 景海峰 | 深圳大學人文社科重點研究基地 |
| 24 | 社會管理創新研究所 | 唐娟 | 深圳大學人文社科重點研究基地 |
| 25 | 勞動法和社會保障法研究所 | 翟玉娟 | 深圳大學人文社科重點研究基地 |
| 序號 | 研究機構名稱 | 負責人 |
| 1 | 國際潮商研究中心 | 李奕標 |
| 2 | 經濟轉型與創新管理研究所 | 崔世娟 |
| 3 | 創新互聯網價值研究所 | 李新立 |
| 4 | 海洋藝術研究中心 | 張巖鑫 |
| 5 | 風險研究中心 | 徐曉光 |
| 6 | 中國海外利益研究院 | 許蔓(執行主任) |
| 7 | 城市治理研究院 | 黃衛平 |
| 8 | 設計藝術研究所 | 龍兆曙 |
| 9 | 成人教育研究所 | 李興敏 |
| 10 | 憲政與人權研究中心 | 鄒平學 |
| 11 | 空間政策與法律研究所 | 尹玉海 |
| 12 | 仲裁研究所 | 韓平 |
| 13 | 國際經濟法律與政策研究所 | 葉興平 |
| 14 | 知識產權研究所 | 朱謝群 |
| 15 | 香港法研究中心 | 姚秀蘭 |
| 16 | 深圳律師研究所 | 曾月英 |
| 17 | 新加坡研究中心 | 呂元禮 |
| 18 | 人力資源發展研究中心 | 劉軍 |
| 19 | 移動互聯網產業研究所 | 李彤 |
| 20 | 婦女研究所 | 陶一桃 |
| 21 | 產業經濟研究中心 | 魏達志 |
| 22 | 中國交通經濟研究所 | 韓彪 |
| 23 | 物流研究所 | 王江 |
| 24 | 會計與財務研究所 | 張建軍 |
| 25 | 財政稅收研究所 | 徐進 |
| 26 | 社會穩定風險評估研究中心 | 謝圣遠 |
| 27 | 互聯網金融研究所 | 陳勇 |
| 28 | 鄧小平理論研究中心 | 江潭瑜 |
| 29 | 道德文化研究所 | 梁桂麟 |
| 30 | 中國系統哲學研究中心 | 烏杰 |
| 31 | 當代中國思想文化研究所 | 王雙印 |
| 32 | 高等教育研究所 | 李均 |
| 33 | 基礎教育與教師發展研究中心 | 李臣 |
| 34 | 美術研究所 | 劉聲雨 |
| 35 | 語言與認知研究中心 | 紀瑛琳 |
| 36 | 西方文化研究中心 | 阮煒 |
| 37 | 比較文學研究所 | 劉洪一 |
| 38 | 應用語言研究所 | 詹勇 |
| 39 | 文藝學研究中心 | 李健 |
| 40 | 中國當代文學創作與研究中心 | 相南翔 |
| 41 | 歷史研究所 | 張小也 |
| 42 | 宗教文化研究所 | 李大華 |
| 43 | 客家研究所 | 張衛東 |
| 44 | 海外中國學研究中心 | 錢超英 |
| 45 | 家具設計研究所 | 唐開軍 |
| 46 | 景觀設計學研究所 | 蔡強 |
| 47 | 陳設藝術設計研究所 | 侯佳彤 |
| 48 | 版畫藝術研究所 | 靳保平 |
| 49 | 特區臺港澳經濟研究所 | 陶一桃 |
| 50 | 人口研究所 | 鐘若愚 |
| 51 | 深圳大學音樂劇創研中心 | 李盾 |
| 52 | 關愛指數研究中心 | 李曉鳳 |
| 53 | 時尚創意研究中心 | 蘇芷庭 |
| 54 | 研究生教育發展研究中心 | 汪永成 |
| 55 | 全民健身與學生體質研究中心 | 席翼 |
| 56 | 商業分析和供應鏈研究所 | 張慶宇 |
| 57 | 深圳市海洋文化研究中心 | 彭鵬 |
| 58 | 深圳大學心理教育與人才測評研究中心 | 王曉鈞 |
| 59 | 應用心理學研究與咨詢中心 | 盧寧 |
| 60 | 中國社會工作實務創新研究中心 | 徐道穩 |
| 61 | 腦功能與心理科學研究中心 | 李紅 |
| 62 | 復雜管理系統建模與優化研究中心 | 潘燕春 |
| 63 | 社會發展與公共政策研究中心 | 周林剛 |
| 64 | 設計與藝術跨界創新實驗室 | 王暉 |
| 65 | 荷蘭研究中心 | 張曉紅 |
| 66 | 劉宇一藝術院 | 劉宇一 |
| 67 | “一帶一路”研究院 | 陶一桃 |
| 68 | 深港青年發展研究中心 | 劉洪一 |
| 69 | 大數據智能管理與決策研究院 | 陳曉紅 |
| 70 | 數量經濟與數據科學研究中心 | 李猛 |
| 71 | 新經濟與金融研究所 | 張揚 |
| 72 | 深大-微眾金融科技研究院 | 張凱 |
| 73 | 生態文明與綠色發展研究院 | 田啟波 |
| 74 | 殘障與公益研究院 | 周林剛 |
| 75 | 故宮學研究院 | 高志忠 |
| 76 | 社會治理與創新研究中心 | 易松國 |
| 77 | 灣區教育研究院 | 趙明仁 |
| 78 | 喻繼高中國工筆畫研究院 | 喻繼高 |
